公司始创于1669年(清康熙八年)，以其药品“配方独特、选料上乘、工艺精湛、疗效显著”闻名于世。历经三百五十余年薪火传承，公司始终遵循“炮制虽繁必不敢省人工，品味虽贵必不敢减物力”的古训，逐步发展成中国最具影响力的中成药生产和销售企业之一。公司于1997年由同仁堂集团独家发起设立，同年，在上海证券交易所主板上市，是同仁堂集团旗下首家上市公司，拥有两家香港联交所上市子公司同仁堂科技、同仁堂国药，以及同仁堂商业、北京同仁堂滦南药业有限公司、北京同仁堂吉林人参有限责任公司、北京同仁堂陕西麝业有限公司、北京同仁堂内蒙古中药材发展有限公司、北京同仁堂蜂业有限公司等多家子公司。